Codeceptionを使ってテストコードを整備しています。
その中で、PhantomJSでのacceptanceテストを作っているのですが、ElementNotVisibleExceptionが出て、なんで？なんで？と悩んでいたのですが、レスポンシブデザインな画面だったので、メニューが隠れていたのでした。PCのモニタだと明らかに表示されているので、気づくのが遅れました。

acceptance.suite.yml

に、

window_size: 1920×1080

と画面サイズをちゃんと設定して解決しました！